Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EPHB2P29323 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB2P29323 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB2P29323 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB2P29323 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB2P29323 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB2P29323 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB2P29323 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB2P29323 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB2P29323 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB2P29323 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB2P29323 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB2P29323 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB2P29323 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB2P29323 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB2P29323 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB2P29323 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB2P29323 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB2P29323 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB2P29323 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB2P29323 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB2P29323 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB2P29323 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB2P29323 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB2P29323 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB2P29323 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB2P29323 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB2P29323 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB2P29323 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB2P29323 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB2P29323 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB2P29323 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB2P29323 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB2P29323 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB2P29323 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB2P29323 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB2P29323 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB2P29323 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB2P29323 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB2P29323 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms