Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF8P28908 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF8P28908 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms