Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCAP28676 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCAP28676 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCAP28676 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCAP28676 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCAP28676 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCAP28676 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCAP28676 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCAP28676 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GCAP28676 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCAP28676 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCAP28676 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCAP28676 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GCAP28676 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GCAP28676 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GCAP28676 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCAP28676 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCAP28676 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCAP28676 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCAP28676 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCAP28676 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCAP28676 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCAP28676 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCAP28676 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCAP28676 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCAP28676 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCAP28676 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCAP28676 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCAP28676 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCAP28676 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCAP28676 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCAP28676 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCAP28676 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCAP28676 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCAP28676 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCAP28676 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GCAP28676 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCAP28676 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCAP28676 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCAP28676 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCAP28676 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCAP28676 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCAP28676 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCAP28676 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCAP28676 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCAP28676 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCAP28676 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCAP28676 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCAP28676 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCAP28676 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCAP28676 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCAP28676 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCAP28676 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCAP28676 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCAP28676 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCAP28676 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCAP28676 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCAP28676 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCAP28676 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCAP28676 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCAP28676 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCAP28676 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCAP28676 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCAP28676 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCAP28676 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCAP28676 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
GCAP28676 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GCAP28676 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GCAP28676 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCAP28676 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCAP28676 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GCAP28676 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCAP28676 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCAP28676 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCAP28676 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCAP28676 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCAP28676 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCAP28676 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCAP28676 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCAP28676 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCAP28676 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCAP28676 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCAP28676 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCAP28676 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCAP28676 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCAP28676 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCAP28676 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCAP28676 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCAP28676 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCAP28676 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCAP28676 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCAP28676 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCAP28676 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCAP28676 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCAP28676 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GCAP28676 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCAP28676 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCAP28676 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCAP28676 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCAP28676 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms