Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CNTFRP26992 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CNTFRP26992 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 235.4 ms