Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMLP26374 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMLP26374 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMLP26374 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMLP26374 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMLP26374 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMLP26374 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMLP26374 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CHMLP26374 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CHMLP26374 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CHMLP26374 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHMLP26374 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CHMLP26374 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHMLP26374 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHMLP26374 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHMLP26374 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHMLP26374 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHMLP26374 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CHMLP26374 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CHMLP26374 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHMLP26374 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CHMLP26374 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHMLP26374 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CHMLP26374 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHMLP26374 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CHMLP26374 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHMLP26374 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHMLP26374 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMLP26374 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMLP26374 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMLP26374 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMLP26374 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMLP26374 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMLP26374 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMLP26374 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMLP26374 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMLP26374 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMLP26374 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMLP26374 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMLP26374 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMLP26374 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMLP26374 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMLP26374 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMLP26374 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMLP26374 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMLP26374 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMLP26374 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMLP26374 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMLP26374 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMLP26374 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMLP26374 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMLP26374 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMLP26374 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMLP26374 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMLP26374 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMLP26374 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMLP26374 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMLP26374 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMLP26374 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMLP26374 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMLP26374 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMLP26374 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMLP26374 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMLP26374 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMLP26374 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMLP26374 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMLP26374 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMLP26374 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHMLP26374 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMLP26374 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMLP26374 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMLP26374 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMLP26374 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMLP26374 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMLP26374 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMLP26374 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMLP26374 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMLP26374 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMLP26374 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMLP26374 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMLP26374 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMLP26374 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMLP26374 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMLP26374 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMLP26374 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMLP26374 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMLP26374 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMLP26374 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMLP26374 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMLP26374 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMLP26374 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMLP26374 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMLP26374 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMLP26374 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMLP26374 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMLP26374 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMLP26374 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMLP26374 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMLP26374 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMLP26374 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms