Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND1P24385 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND1P24385 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND1P24385 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND1P24385 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND1P24385 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND1P24385 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND1P24385 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND1P24385 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND1P24385 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND1P24385 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND1P24385 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND1P24385 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND1P24385 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND1P24385 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND1P24385 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND1P24385 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND1P24385 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND1P24385 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND1P24385 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND1P24385 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND1P24385 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND1P24385 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND1P24385 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND1P24385 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND1P24385 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND1P24385 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND1P24385 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND1P24385 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND1P24385 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND1P24385 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND1P24385 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND1P24385 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND1P24385 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND1P24385 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND1P24385 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND1P24385 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND1P24385 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND1P24385 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND1P24385 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND1P24385 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND1P24385 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND1P24385 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND1P24385 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND1P24385 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND1P24385 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND1P24385 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND1P24385 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCND1P24385 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCND1P24385 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCND1P24385 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCND1P24385 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCND1P24385 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCND1P24385 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCND1P24385 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCND1P24385 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCND1P24385 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCND1P24385 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCND1P24385 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCND1P24385 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCND1P24385 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCND1P24385 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCND1P24385 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCND1P24385 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCND1P24385 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCND1P24385 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCND1P24385 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCND1P24385 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCND1P24385 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCND1P24385 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCND1P24385 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCND1P24385 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCND1P24385 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCND1P24385 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCND1P24385 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCND1P24385 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCND1P24385 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCND1P24385 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCND1P24385 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCND1P24385 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCND1P24385 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCND1P24385 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCND1P24385 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCND1P24385 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCND1P24385 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCND1P24385 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCND1P24385 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCND1P24385 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCND1P24385 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCND1P24385 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCND1P24385 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCND1P24385 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCND1P24385 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCND1P24385 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCND1P24385 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCND1P24385 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCND1P24385 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCND1P24385 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCND1P24385 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCND1P24385 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms