Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPS6KB1P23443 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPS6KB1P23443 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1183.6 ms