Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM21P19474 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM21P19474 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms