Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT4P19013 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT4P19013 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT4P19013 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT4P19013 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT4P19013 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT4P19013 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT4P19013 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT4P19013 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT4P19013 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT4P19013 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT4P19013 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT4P19013 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT4P19013 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT4P19013 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT4P19013 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT4P19013 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT4P19013 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT4P19013 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT4P19013 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT4P19013 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT4P19013 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT4P19013 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT4P19013 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT4P19013 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT4P19013 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT4P19013 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT4P19013 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT4P19013 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT4P19013 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT4P19013 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT4P19013 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT4P19013 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT4P19013 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT4P19013 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT4P19013 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT4P19013 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT4P19013 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT4P19013 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT4P19013 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT4P19013 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT4P19013 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT4P19013 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT4P19013 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT4P19013 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT4P19013 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT4P19013 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT4P19013 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT4P19013 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT4P19013 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT4P19013 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT4P19013 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT4P19013 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT4P19013 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT4P19013 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT4P19013 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT4P19013 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT4P19013 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT4P19013 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT4P19013 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT4P19013 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT4P19013 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT4P19013 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT4P19013 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT4P19013 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT4P19013 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT4P19013 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT4P19013 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT4P19013 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT4P19013 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT4P19013 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT4P19013 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT4P19013 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT4P19013 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT4P19013 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT4P19013 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT4P19013 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT4P19013 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT4P19013 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT4P19013 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT4P19013 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT4P19013 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT4P19013 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT4P19013 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT4P19013 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT4P19013 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT4P19013 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT4P19013 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT4P19013 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT4P19013 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT4P19013 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT4P19013 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT4P19013 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT4P19013 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT4P19013 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT4P19013 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT4P19013 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT4P19013 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT4P19013 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT4P19013 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms