Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHCEP18577 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RHCEP18577 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RHCEP18577 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RHCEP18577 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RHCEP18577 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RHCEP18577 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RHCEP18577 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHCEP18577 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHCEP18577 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHCEP18577 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHCEP18577 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHCEP18577 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHCEP18577 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHCEP18577 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RHCEP18577 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHCEP18577 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHCEP18577 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHCEP18577 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHCEP18577 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHCEP18577 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHCEP18577 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHCEP18577 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RHCEP18577 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHCEP18577 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHCEP18577 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHCEP18577 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHCEP18577 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHCEP18577 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHCEP18577 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHCEP18577 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHCEP18577 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RHCEP18577 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHCEP18577 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHCEP18577 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHCEP18577 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHCEP18577 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHCEP18577 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHCEP18577 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHCEP18577 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHCEP18577 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHCEP18577 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHCEP18577 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHCEP18577 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHCEP18577 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHCEP18577 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHCEP18577 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHCEP18577 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHCEP18577 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHCEP18577 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHCEP18577 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHCEP18577 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHCEP18577 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHCEP18577 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHCEP18577 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHCEP18577 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHCEP18577 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHCEP18577 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHCEP18577 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHCEP18577 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHCEP18577 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RHCEP18577 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHCEP18577 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RHCEP18577 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHCEP18577 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHCEP18577 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHCEP18577 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHCEP18577 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RHCEP18577 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHCEP18577 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHCEP18577 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHCEP18577 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHCEP18577 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHCEP18577 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHCEP18577 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHCEP18577 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHCEP18577 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHCEP18577 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHCEP18577 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHCEP18577 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHCEP18577 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHCEP18577 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHCEP18577 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RHCEP18577 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RHCEP18577 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RHCEP18577 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RHCEP18577 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHCEP18577 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHCEP18577 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHCEP18577 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHCEP18577 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHCEP18577 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHCEP18577 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHCEP18577 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHCEP18577 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHCEP18577 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHCEP18577 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHCEP18577 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHCEP18577 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHCEP18577 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms