Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CAPN2P17655 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN2P17655 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms