Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXB8P17481 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB8P17481 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms