Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMPD1P17405 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMPD1P17405 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms