Protein–RNA interactions for Protein: P15621

ZNF44, Zinc finger protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF44P15621 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF44P15621 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF44P15621 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms