Protein–RNA interactions for Protein: P13611

VCAN, Versican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCANP13611 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VCANP13611 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VCANP13611 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VCANP13611 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VCANP13611 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VCANP13611 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VCANP13611 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VCANP13611 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VCANP13611 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VCANP13611 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VCANP13611 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VCANP13611 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VCANP13611 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCANP13611 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCANP13611 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCANP13611 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCANP13611 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCANP13611 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VCANP13611 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCANP13611 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCANP13611 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCANP13611 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCANP13611 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCANP13611 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCANP13611 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCANP13611 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCANP13611 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCANP13611 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VCANP13611 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCANP13611 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCANP13611 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCANP13611 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCANP13611 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCANP13611 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCANP13611 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCANP13611 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VCANP13611 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCANP13611 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCANP13611 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCANP13611 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCANP13611 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCANP13611 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCANP13611 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCANP13611 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCANP13611 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCANP13611 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCANP13611 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VCANP13611 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCANP13611 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCANP13611 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCANP13611 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCANP13611 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCANP13611 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VCANP13611 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCANP13611 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCANP13611 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCANP13611 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCANP13611 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCANP13611 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCANP13611 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCANP13611 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCANP13611 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VCANP13611 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VCANP13611 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VCANP13611 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
VCANP13611 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VCANP13611 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VCANP13611 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VCANP13611 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VCANP13611 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCANP13611 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCANP13611 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCANP13611 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCANP13611 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCANP13611 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCANP13611 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCANP13611 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCANP13611 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCANP13611 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCANP13611 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCANP13611 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCANP13611 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VCANP13611 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCANP13611 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VCANP13611 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCANP13611 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCANP13611 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCANP13611 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCANP13611 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCANP13611 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCANP13611 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCANP13611 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VCANP13611 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCANP13611 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCANP13611 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCANP13611 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VCANP13611 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VCANP13611 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCANP13611 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCANP13611 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms