Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCG2P13521 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCG2P13521 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCG2P13521 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCG2P13521 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCG2P13521 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCG2P13521 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCG2P13521 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCG2P13521 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCG2P13521 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCG2P13521 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCG2P13521 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCG2P13521 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCG2P13521 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCG2P13521 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCG2P13521 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCG2P13521 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCG2P13521 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCG2P13521 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCG2P13521 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCG2P13521 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCG2P13521 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCG2P13521 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCG2P13521 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCG2P13521 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SCG2P13521 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCG2P13521 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCG2P13521 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCG2P13521 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCG2P13521 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCG2P13521 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCG2P13521 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCG2P13521 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCG2P13521 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCG2P13521 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCG2P13521 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCG2P13521 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCG2P13521 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SCG2P13521 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCG2P13521 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SCG2P13521 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCG2P13521 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCG2P13521 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCG2P13521 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCG2P13521 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCG2P13521 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCG2P13521 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCG2P13521 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCG2P13521 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCG2P13521 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCG2P13521 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCG2P13521 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCG2P13521 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SCG2P13521 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCG2P13521 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCG2P13521 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCG2P13521 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCG2P13521 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCG2P13521 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCG2P13521 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCG2P13521 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCG2P13521 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCG2P13521 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCG2P13521 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCG2P13521 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCG2P13521 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCG2P13521 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCG2P13521 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCG2P13521 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCG2P13521 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCG2P13521 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCG2P13521 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCG2P13521 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCG2P13521 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCG2P13521 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SCG2P13521 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCG2P13521 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCG2P13521 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCG2P13521 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCG2P13521 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCG2P13521 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SCG2P13521 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SCG2P13521 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCG2P13521 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SCG2P13521 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SCG2P13521 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SCG2P13521 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SCG2P13521 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCG2P13521 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCG2P13521 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCG2P13521 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCG2P13521 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCG2P13521 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCG2P13521 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCG2P13521 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCG2P13521 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCG2P13521 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SCG2P13521 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCG2P13521 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCG2P13521 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms