Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXD8P13378 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms