Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT3P12035 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT3P12035 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT3P12035 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT3P12035 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT3P12035 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT3P12035 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT3P12035 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT3P12035 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT3P12035 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT3P12035 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT3P12035 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT3P12035 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT3P12035 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT3P12035 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT3P12035 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT3P12035 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT3P12035 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT3P12035 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT3P12035 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT3P12035 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT3P12035 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT3P12035 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT3P12035 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT3P12035 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT3P12035 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT3P12035 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT3P12035 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT3P12035 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT3P12035 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT3P12035 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT3P12035 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT3P12035 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT3P12035 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT3P12035 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT3P12035 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT3P12035 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT3P12035 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT3P12035 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT3P12035 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT3P12035 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT3P12035 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT3P12035 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT3P12035 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT3P12035 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT3P12035 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT3P12035 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT3P12035 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT3P12035 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT3P12035 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT3P12035 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT3P12035 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT3P12035 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT3P12035 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT3P12035 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT3P12035 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT3P12035 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT3P12035 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT3P12035 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT3P12035 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT3P12035 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT3P12035 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT3P12035 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT3P12035 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT3P12035 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT3P12035 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT3P12035 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT3P12035 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT3P12035 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT3P12035 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT3P12035 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT3P12035 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT3P12035 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT3P12035 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT3P12035 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT3P12035 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT3P12035 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT3P12035 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT3P12035 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT3P12035 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT3P12035 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT3P12035 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT3P12035 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT3P12035 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT3P12035 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT3P12035 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT3P12035 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT3P12035 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT3P12035 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT3P12035 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT3P12035 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT3P12035 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT3P12035 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT3P12035 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT3P12035 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT3P12035 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT3P12035 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT3P12035 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT3P12035 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT3P12035 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms