Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBB4AP04350 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBB4AP04350 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 643.2 ms