Protein–RNA interactions for Protein: P01834

IGKC, Immunoglobulin kappa constant, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKCP01834 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGKCP01834 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGKCP01834 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGKCP01834 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGKCP01834 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGKCP01834 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGKCP01834 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKCP01834 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKCP01834 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKCP01834 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKCP01834 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKCP01834 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKCP01834 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKCP01834 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKCP01834 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKCP01834 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKCP01834 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKCP01834 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKCP01834 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKCP01834 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGKCP01834 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKCP01834 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKCP01834 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKCP01834 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKCP01834 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKCP01834 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKCP01834 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKCP01834 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKCP01834 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKCP01834 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKCP01834 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKCP01834 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKCP01834 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKCP01834 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKCP01834 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKCP01834 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKCP01834 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKCP01834 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKCP01834 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKCP01834 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGKCP01834 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGKCP01834 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGKCP01834 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGKCP01834 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGKCP01834 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGKCP01834 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGKCP01834 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGKCP01834 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGKCP01834 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGKCP01834 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGKCP01834 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGKCP01834 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGKCP01834 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGKCP01834 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGKCP01834 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGKCP01834 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGKCP01834 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKCP01834 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKCP01834 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKCP01834 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKCP01834 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKCP01834 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKCP01834 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKCP01834 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKCP01834 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKCP01834 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKCP01834 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKCP01834 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKCP01834 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKCP01834 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKCP01834 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKCP01834 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKCP01834 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKCP01834 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKCP01834 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKCP01834 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKCP01834 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKCP01834 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKCP01834 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKCP01834 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKCP01834 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKCP01834 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKCP01834 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKCP01834 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKCP01834 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKCP01834 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKCP01834 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKCP01834 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKCP01834 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKCP01834 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKCP01834 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKCP01834 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKCP01834 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKCP01834 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKCP01834 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKCP01834 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKCP01834 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKCP01834 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKCP01834 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKCP01834 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms