Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACSL3O95573 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSL3O95573 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms