Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ALDH1A2O94788 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALDH1A2O94788 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms