Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA2O43364 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA2O43364 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA2O43364 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms