Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MTSS1O43312 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTSS1O43312 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTSS1O43312 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms