Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTIFO43310 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTIFO43310 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTIFO43310 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTIFO43310 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTIFO43310 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTIFO43310 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTIFO43310 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTIFO43310 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTIFO43310 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTIFO43310 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTIFO43310 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTIFO43310 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTIFO43310 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTIFO43310 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTIFO43310 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTIFO43310 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTIFO43310 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTIFO43310 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTIFO43310 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTIFO43310 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTIFO43310 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTIFO43310 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTIFO43310 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTIFO43310 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTIFO43310 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTIFO43310 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTIFO43310 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTIFO43310 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTIFO43310 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTIFO43310 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CTIFO43310 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTIFO43310 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTIFO43310 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTIFO43310 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTIFO43310 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTIFO43310 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTIFO43310 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTIFO43310 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTIFO43310 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTIFO43310 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTIFO43310 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTIFO43310 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTIFO43310 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTIFO43310 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTIFO43310 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTIFO43310 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTIFO43310 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTIFO43310 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTIFO43310 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTIFO43310 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTIFO43310 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTIFO43310 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTIFO43310 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTIFO43310 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTIFO43310 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTIFO43310 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTIFO43310 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTIFO43310 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CTIFO43310 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CTIFO43310 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CTIFO43310 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CTIFO43310 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CTIFO43310 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CTIFO43310 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CTIFO43310 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CTIFO43310 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CTIFO43310 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTIFO43310 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTIFO43310 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTIFO43310 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTIFO43310 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CTIFO43310 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTIFO43310 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CTIFO43310 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTIFO43310 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTIFO43310 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTIFO43310 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTIFO43310 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTIFO43310 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTIFO43310 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTIFO43310 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTIFO43310 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTIFO43310 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTIFO43310 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTIFO43310 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTIFO43310 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTIFO43310 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTIFO43310 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTIFO43310 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTIFO43310 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTIFO43310 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTIFO43310 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTIFO43310 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTIFO43310 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTIFO43310 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTIFO43310 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTIFO43310 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTIFO43310 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTIFO43310 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms