Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBDO15205 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBDO15205 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBDO15205 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBDO15205 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBDO15205 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UBDO15205 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBDO15205 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBDO15205 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBDO15205 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBDO15205 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBDO15205 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBDO15205 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBDO15205 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBDO15205 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBDO15205 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBDO15205 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBDO15205 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBDO15205 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBDO15205 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBDO15205 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBDO15205 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBDO15205 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBDO15205 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UBDO15205 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBDO15205 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBDO15205 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBDO15205 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBDO15205 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBDO15205 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBDO15205 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBDO15205 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBDO15205 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UBDO15205 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UBDO15205 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBDO15205 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBDO15205 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBDO15205 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBDO15205 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBDO15205 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBDO15205 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBDO15205 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBDO15205 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBDO15205 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBDO15205 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBDO15205 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBDO15205 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBDO15205 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBDO15205 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
UBDO15205 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBDO15205 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBDO15205 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBDO15205 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBDO15205 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBDO15205 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBDO15205 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBDO15205 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBDO15205 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBDO15205 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBDO15205 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBDO15205 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBDO15205 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBDO15205 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBDO15205 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBDO15205 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBDO15205 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBDO15205 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBDO15205 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBDO15205 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBDO15205 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
UBDO15205 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBDO15205 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UBDO15205 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBDO15205 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBDO15205 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UBDO15205 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBDO15205 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBDO15205 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBDO15205 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBDO15205 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBDO15205 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBDO15205 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBDO15205 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBDO15205 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBDO15205 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBDO15205 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
UBDO15205 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBDO15205 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBDO15205 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBDO15205 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBDO15205 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBDO15205 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBDO15205 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBDO15205 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBDO15205 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBDO15205 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBDO15205 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UBDO15205 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBDO15205 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBDO15205 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms