Protein–RNA interactions for Protein: O14896

IRF6, Interferon regulatory factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF6O14896 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRF6O14896 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
IRF6O14896 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRF6O14896 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRF6O14896 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRF6O14896 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRF6O14896 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRF6O14896 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRF6O14896 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRF6O14896 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRF6O14896 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRF6O14896 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRF6O14896 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRF6O14896 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRF6O14896 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRF6O14896 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRF6O14896 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
IRF6O14896 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
IRF6O14896 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRF6O14896 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRF6O14896 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRF6O14896 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRF6O14896 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRF6O14896 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRF6O14896 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRF6O14896 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRF6O14896 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRF6O14896 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRF6O14896 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRF6O14896 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRF6O14896 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRF6O14896 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRF6O14896 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRF6O14896 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRF6O14896 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRF6O14896 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRF6O14896 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRF6O14896 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRF6O14896 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRF6O14896 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRF6O14896 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRF6O14896 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
IRF6O14896 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRF6O14896 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
IRF6O14896 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRF6O14896 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRF6O14896 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRF6O14896 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRF6O14896 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRF6O14896 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRF6O14896 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRF6O14896 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRF6O14896 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRF6O14896 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
IRF6O14896 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
IRF6O14896 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRF6O14896 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRF6O14896 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRF6O14896 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRF6O14896 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
IRF6O14896 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRF6O14896 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRF6O14896 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRF6O14896 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRF6O14896 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRF6O14896 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRF6O14896 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRF6O14896 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRF6O14896 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRF6O14896 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRF6O14896 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
IRF6O14896 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRF6O14896 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRF6O14896 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRF6O14896 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRF6O14896 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRF6O14896 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRF6O14896 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRF6O14896 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRF6O14896 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
IRF6O14896 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
IRF6O14896 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRF6O14896 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRF6O14896 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRF6O14896 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRF6O14896 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRF6O14896 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRF6O14896 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRF6O14896 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRF6O14896 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRF6O14896 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRF6O14896 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRF6O14896 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRF6O14896 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRF6O14896 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRF6O14896 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
IRF6O14896 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRF6O14896 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRF6O14896 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRF6O14896 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms