Protein–RNA interactions for Protein: D6RJB6

USP17L20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L20D6RJB6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP17L20D6RJB6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP17L20D6RJB6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP17L20D6RJB6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP17L20D6RJB6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP17L20D6RJB6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP17L20D6RJB6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
USP17L20D6RJB6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP17L20D6RJB6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP17L20D6RJB6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP17L20D6RJB6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP17L20D6RJB6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms