Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ERVV-2B6SEH9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ERVV-2B6SEH9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERVV-2B6SEH9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERVV-2B6SEH9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERVV-2B6SEH9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERVV-2B6SEH9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERVV-2B6SEH9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERVV-2B6SEH9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERVV-2B6SEH9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERVV-2B6SEH9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERVV-2B6SEH9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERVV-2B6SEH9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ERVV-2B6SEH9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ERVV-2B6SEH9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ERVV-2B6SEH9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ERVV-2B6SEH9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ERVV-2B6SEH9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ERVV-2B6SEH9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ERVV-2B6SEH9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ERVV-2B6SEH9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERVV-2B6SEH9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERVV-2B6SEH9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms