Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM1B2RUZ4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM1B2RUZ4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms