Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
LINC00587B1AMM8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00587B1AMM8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms