Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.1 ms