Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP27XA6NNY8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms