Protein–RNA interactions for Protein: A6NKG5

RTL1, Retrotransposon-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL1A6NKG5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RTL1A6NKG5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RTL1A6NKG5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RTL1A6NKG5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RTL1A6NKG5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RTL1A6NKG5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RTL1A6NKG5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RTL1A6NKG5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RTL1A6NKG5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RTL1A6NKG5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
RTL1A6NKG5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RTL1A6NKG5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.37
RTL1A6NKG5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RTL1A6NKG5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RTL1A6NKG5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RTL1A6NKG5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RTL1A6NKG5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RTL1A6NKG5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RTL1A6NKG5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
RTL1A6NKG5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
RTL1A6NKG5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RTL1A6NKG5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RTL1A6NKG5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RTL1A6NKG5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RTL1A6NKG5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RTL1A6NKG5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RTL1A6NKG5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RTL1A6NKG5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RTL1A6NKG5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
RTL1A6NKG5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RTL1A6NKG5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RTL1A6NKG5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RTL1A6NKG5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RTL1A6NKG5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RTL1A6NKG5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RTL1A6NKG5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RTL1A6NKG5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RTL1A6NKG5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RTL1A6NKG5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RTL1A6NKG5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RTL1A6NKG5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RTL1A6NKG5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms