Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERINC4A6NH21 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SERINC4A6NH21 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 235 ms