Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GMNCA6NCL1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GMNCA6NCL1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms