Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SSPOA2VEC9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms