Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMX2A2RU54 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HMX2A2RU54 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMX2A2RU54 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms