Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXV3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A0A0J9YXV3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms