Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR3A4P-202ENST00000624752 1461 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM13C-201ENST00000422313 1963 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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KRTAP9-4Q9BYQ2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 USP14-203ENST00000400266 1681 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 FANCL-202ENST00000402135 1698 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP4B1-AS1-201ENST00000419536 1734 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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KRTAP9-4Q9BYQ2 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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KRTAP9-4Q9BYQ2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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KRTAP9-4Q9BYQ2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 TCF4-210ENST00000561831 1823 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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KRTAP9-4Q9BYQ2 IFT43-201ENST00000238628 816 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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KRTAP9-4Q9BYQ2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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KRTAP9-4Q9BYQ2 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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KRTAP9-4Q9BYQ2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 SALL4-202ENST00000371539 1151 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 PSMD10-205ENST00000372295 779 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 AAMDC-202ENST00000393427 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092431.1-201ENST00000415342 420 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC007359.1-201ENST00000417910 745 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00460-201ENST00000435024 631 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRSS37-203ENST00000438520 826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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