Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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ZNF397Q8NF99 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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ZNF397Q8NF99 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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ZNF397Q8NF99 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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ZNF397Q8NF99 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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ZNF397Q8NF99 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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ZNF397Q8NF99 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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ZNF397Q8NF99 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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ZNF397Q8NF99 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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ZNF397Q8NF99 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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ZNF397Q8NF99 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF397Q8NF99 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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