Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms