Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 LAMTOR5-203ENST00000474861 1154 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 COPZ1-207ENST00000549116 736 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRPM1-210ENST00000559179 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL34-206ENST00000602206 603 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 FHL2-208ENST00000409807 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALOX15P2-201ENST00000340858 1897 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZFP37-203ENST00000555206 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 MPPE1-204ENST00000344987 1831 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPINK4-201ENST00000379721 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL078621.2-201ENST00000419351 698 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC006967.2-201ENST00000426169 432 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 GOSR1-205ENST00000467337 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDIAS-204ENST00000525388 961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGHV3OR16-11-201ENST00000565524 349 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZG16B-204ENST00000572863 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 RETREG3-203ENST00000585894 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 GSDMB-201ENST00000309481 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 OSER1-AS1-202ENST00000437730 1563 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLHDC2-211ENST00000557247 1565 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDEL1-203ENST00000402554 1858 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC069257.3-201ENST00000431391 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC106748.1-201ENST00000454801 384 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIEZO1P1-201ENST00000485427 219 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC108112.1-201ENST00000505567 659 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR22HG-206ENST00000573127 899 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC073592.10-201ENST00000624789 597 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 MPI-208ENST00000563786 1707 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 UGT1A1-201ENST00000305208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 MEFV-209ENST00000541159 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLXNA4-203ENST00000378539 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIPEPP1-201ENST00000413533 2027 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAGED2-205ENST00000375060 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGHV1-45-201ENST00000390621 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDK2AP2P2-201ENST00000478512 367 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC079340.2-201ENST00000504957 495 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPTY2D1-AS1-202ENST00000511927 573 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 ROPN1L-AS1-201ENST00000513037 189 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 VEGFA-225ENST00000523950 954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 DEGS2-202ENST00000553834 421 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007608.2-201ENST00000569940 1146 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC116036.2-201ENST00000607592 462 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL341P-201ENST00000613745 298 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM69A-204ENST00000615519 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 LUC7L-203ENST00000397780 1335 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 OBP2A-202ENST00000342114 607 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHBP3-201ENST00000412562 819 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012513.2-201ENST00000441511 1137 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004923.1-201ENST00000527543 776 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZFYVE1-206ENST00000555072 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 OSGIN1-206ENST00000565123 833 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM106A-204ENST00000588659 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC087893.1-201ENST00000612818 664 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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