Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 MOCS1-204ENST00000373188 3358 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 EPB41L1-206ENST00000373950 3631 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 SRP72-205ENST00000510663 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 CCDC14-220ENST00000488653 4156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 CLGN-201ENST00000325617 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 CES1-201ENST00000360526 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 COX7A2L-202ENST00000378669 3056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 ABLIM2-206ENST00000447017 2902 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 PDZRN3-205ENST00000466780 2737 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 ARHGEF9-226ENST00000636392 1920 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 ADIRF-AS1-203ENST00000609111 3822 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC112Q8NEF3 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms