Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FOSBP53539 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOSBP53539 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FOSBP53539 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOSBP53539 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOSBP53539 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FOSBP53539 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOSBP53539 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOSBP53539 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOSBP53539 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FOSBP53539 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FOSBP53539 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOSBP53539 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOSBP53539 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOSBP53539 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOSBP53539 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOSBP53539 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOSBP53539 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOSBP53539 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOSBP53539 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOSBP53539 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOSBP53539 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOSBP53539 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOSBP53539 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOSBP53539 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOSBP53539 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOSBP53539 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOSBP53539 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOSBP53539 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOSBP53539 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 TTTY14-204ENST00000452584 860 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 Metazoa_SRP.12-201ENST00000553249 268 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOSBP53539 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOSBP53539 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOSBP53539 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOSBP53539 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOSBP53539 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOSBP53539 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOSBP53539 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOSBP53539 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOSBP53539 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOSBP53539 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOSBP53539 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOSBP53539 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOSBP53539 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOSBP53539 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOSBP53539 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOSBP53539 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOSBP53539 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOSBP53539 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOSBP53539 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms