Protein–RNA interactions for Protein: P40222

TXLNA, Alpha-taxilin, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXLNAP40222 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TXLNAP40222 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms