Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 FANK1-203ENST00000368693 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 SERPINB8P1-201ENST00000401898 377 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AL137077.1-201ENST00000442115 528 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 HTATIP2-203ENST00000443524 967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC253536.5-201ENST00000506097 347 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 CD276-217ENST00000564751 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC131274.3-201ENST00000578745 1271 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC018766.1-201ENST00000601211 484 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC063977.2-201ENST00000601996 421 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC022382.1-201ENST00000602768 336 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC116036.2-201ENST00000607592 462 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC010601.2-201ENST00000623060 774 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC012594.1-273ENST00000626618 816 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 TRPC5OS-203ENST00000635763 955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 HYKK-201ENST00000388988 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 ZNF32-AS2-201ENST00000418966 905 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC079325.1-201ENST00000430386 857 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 TMEM256P1-201ENST00000430550 340 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 DHRSX-IT1-201ENST00000437244 651 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC139143.1-201ENST00000441772 1207 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 IGKV3-11-201ENST00000483158 392 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC098591.1-202ENST00000507914 937 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 STMN4-203ENST00000519614 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AACSP1-202ENST00000521412 1095 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 SLC22A18AS-202ENST00000526203 664 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC025219.1-201ENST00000559299 526 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 MIR4526-201ENST00000583168 87 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 RPL26-209ENST00000584164 873 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC136475.9-201ENST00000605240 497 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 GPHB5-202ENST00000621500 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 LUC7L3-223ENST00000625349 408 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 GTF3A-209ENST00000640289 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 ATP6V0D1-218ENST00000602876 1554 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 IMPDH1P5-201ENST00000439688 1540 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 SUCLG2-203ENST00000492795 1512 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 TRMT11-202ENST00000368332 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 LINC01137-201ENST00000424989 1395 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms