Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMG5Q9UPR3 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms