Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 AC104590.1-202ENST00000558368 1921 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 HMGB1-202ENST00000339872 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 ADPRH-202ENST00000465513 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RRBP1Q9P2E9 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 RPS15P5-201ENST00000449885 432 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 AS3MT-202ENST00000615257 1723 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 ACOX2-201ENST00000302819 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 AIFM1P1-201ENST00000413342 1841 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 AP000229.1-201ENST00000608591 1979 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 MRPL43-202ENST00000318325 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 AL357140.1-201ENST00000454104 424 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RRBP1Q9P2E9 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms