Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 AC025580.1-201ENST00000559553 729 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 LINC00484-201ENST00000414768 561 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 ETFRF1-207ENST00000556351 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSRNP3Q8WYN3 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms